Два года спустя после распада Тайной корпорации из-за непонимания между Скуби-Ду и его умными друзьями, Фред, Дафна, Шэгги и Вельма были приглашены на Зловещий остров, чтобы расследовать серию паранормальных явлений, происходящих на Спринг-Брейк. Владелец острова, Эмиль Мондавариус, опасается, что его популярный курорт действительно может быть населен призраками, поэтому он желает, чтобы легендарные детективы разрешили эту загадку до того, как сверхъестественные существа запугают всех отдыхающих студентов. Скуби-Ду и его команде предстоит преодолеть личные разногласия и изменить свое отношение к вампирам и призракам. Все это для того, чтобы разрешить дело, спасти себя, и возможно... весь мир...