Сериал "Мутанты Икс" рассказывает о приключениях людей-мутантов, которые стали негодяями вследствие экспериментов, проводимых в области генной инженерии. После научных опытов, которые тайно проводятся по приказу правительства, они получают сверхъестественные силы и способности. В связи с тем, что ситуация выходит из-под контроля, организация, ответственная за создание этих супергероев, теперь пытается уничтожить их. Один из ученых, непосредственно участвующий в разработке программы, по имени Адам, решает помочь мутантам. Он создает команду, состоящую из четырех мутантов, известную как команда "Мутанты Икс". Цель этой команды - найти своих соратников, помочь им осознать и овладеть своими необычными способностями, а также защитить их от их собственных создателей, в частности от одного из коллег Адама по имени Мейсон Экхарт.