Синдзиро Хаята - сын Сина Хаяты, который был первым Ультраменом - наделен особенной силой. Когда Синдзиро подвергается нападению неизвестных, он узнает о своей наследственности. Ультрамен спасает Синдзиру и сообщает, что он - его отец. Синдзиро надевает костюм Ультрамена от мистера Идо, бывшего члена Специального научно-исследовательского отряда, и решает помогать своему отцу во всем. Впереди их ждет большая битва.